Бумажный самолет (verola) wrote,
Бумажный самолет
verola

Categories:

Когда Ло быстрей Мурло



На картинке.

Все знают закон Мура (Moore's law, на русском Мурло) - количество транзисторов на кристалле удваивается каждые 24 месяца. Самая удивительная вещь про него, что он продолжает выполняться 55 лет подряд. Несмотря на то, что последние 20 лет каждый год делается достоверное предсказание, что "закон Мура через 2 года упрется в физические пределы возможного".

Но есть кое-какие области науки, которые будут заметно быстрее Мурло.


Стоимость изготовления полного человеческого генома подешевела за 20 лет в 100,000 раз! Со $100,000,000 до $1000. Это примерно в 100 раз быстрее, чем по закону Мура. Это ясно видно на картинке.

Причем между 2000 и 2007 удешевление шло точно по Муру, а потом была пара резких улучшений. В чем разница? В генетике все еще возможны прорывные открытия, и они имели место в районе 2007 и 2014 годов.

* * * *

Сегодня, если вам пытаются впарить чтение вашего генома (пишу для гуманоидов стандартных, сорри все остальные) дороже $600, то это жулики. Вполне можно найти и за $200 (похуже качеством), и не прекращаются обещания, что вот-вот $100 станет стандартной ценой за человеческий геном. Вот когда будет $100 (а лучше $50), то это будет еще следующая Вселенная.

Возможные приложения - и про каждое можно и нужно написать по 5 статей - многое уже есть в зачатке - остальное Бизнесы Будущего:

*** Супер ранняя диагностика болезней;
*** Коррекции предрасположенностей к болезням;
*** Детская профориентация;
*** Психологические тренировки, основанные на особенностях личности;
*** Индивидуально нацеленные системы Питания, Спорта, Режима дня;

* * * *

Позитивные возможности ПРОСТО БЕСКОНЕЧНЫ. И, конечно, если в генах прописано "Серийный убийца-психопат", то, возможно, избиратели имеют право иметь доступ к таким профессиональным склонностям кандидата.

1. $100 Genome Sequencing Will Yield a Treasure Trove of Genetic Data
https://singularityhub.com/2020/03/08/100-genome-sequencing-will-yield-a-treasure-trove-of-genetic-data-and-maybe-a-dystopian-nightmare/
Tags: генетика, сингулярность
Subscribe

Posts from This Journal “генетика” Tag

promo verola июль 24, 2016 21:00 301
Buy for 200 tokens
На картинке Жанна Ким. Когда спорят прекрасные дамы, а вы собираетесь вмешаться, выясните сначала какие силы стоят за каждой дамой, потому что беспризорными они бывают редко. Чтобы не оказаться со своим хвостом и копытом сатира перед 20-метровым Зевсом в лютом гневе. Акт 1. Наказать по…
  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

  • 82 comments

Bestirrelative

December 7 2021, 05:53:37 UTC 3 years ago Edited:  December 7 2021, 05:56:20 UTC

  • New comment
Полный геном кого? Человека? Ну, вот что получается.
Смотрю на сайте Illumina:
Их самый крутой аппарат NovaSeq 6000 делает до 20 миллиардов сиквенсов за раз. Длина прочтения 2х150 оснований — то есть 150 оснований читаются с обоих концов. То-есть максимальная продуктивность при размере фрагмента >300 оснований 2х10^10х300=6х10^12
Диплоидный геном человека 6,4 миллиарда оснований. 6,4Х10^9
То есть за один проход получаем 937 диплоидных геномов за один прогон.
Я не знаю каковы расходы (сама машина стоит $985000), но я прошелся по провайдерам и они в среднем хотят $20000 за один сиквенс, правда продуктивность обещают примерно в 10 раз ниже.
Имеем 94 диплоидных генома за $20000 или $212 за штуку.
Это всего лишь 2Х покрытие (его обычно в гаплоидных геномах считают), что конечно ни для какого серьезного анализа не годится (например, стандартом для сборки считается >100X, хотя конечно, на одной Иллюмине ничего не соберешь, слишком короткие куски). Если же вытянуть продуктивность на уровень, который обещает производитель то за те же деньги уже будет 20X — и вот с этим уже можно работать.
Посмотрел, Dante Labs обещают в среднем 30х coverage. Ну да, по цене ($550) где-то примерно в этом районе и получается.

Posts from This Journal “генетика” Tag